A bélgyulladás tünetei a hasmenés, a görcsölés, a véres széklet, kialakulhat következtében fekély vagy tályog. A betegségben szenvedők fogyással, étvágytalansággal küzdenek, esetenként lázzal is kell számolniuk.
Hasmenés
A Crohn-betegségben a vastagbél képtelen felszívni a többletfolyadékot, emiatt alakul ki a hasmenés.
Fájdalom, görcsölés
A bélgyulladás hegesedést okozhat, ezért érezhet a beteg fájdalmat. Hányinger is előfordulhat.
Véres széklet
Másik jellemző tünet a vérzés, ezt okozhatja a megevett étel is, ami felsérti a gyulladt szövetet. Előfordul olyan eset is, amikor szabad szemmel nem látható a vér.
Fekély
A bél felszínén apró sebekkel kezdődik a betegség, ezekből lesz később a nagyméretű fekély. A szájban is megjelenhet.
Tályog
A Crohn-betegség gyulladásmélyedéseket hozhat létre a bélfalban, amelyek átjárást biztosítanak a hüvelybe és a hólyagba, ezek a fisztulák. Ennek a nyílása megjelenhet a felszínen, legtöbbször a végbélnyílás tájékán.
Egyéb tünetek
A Crohn-betegek gyakran számolnak be fogyásról, étvágytalanságról. Súlyosabb esetben előfordulhat láz, fáradtság, vagy akár szem-, májgyulladás, epeúti panaszok. A Crohn-beteg gyerekek társaikhoz képest lassabban fejlődnek, szexuális érésük is elmarad a többiekétől.